Первый арест

На 10 март 1919 г. без сериозни обвинения той е затворен в Бутирския затвор, където остава до 7 юни. Архимандрит Иларион е толкова чужд на духа на унинието, че дори в затвора той не само не пада духом, но намира и положителни моменти. Ако пропуснем споменаването на затвора, може да остане впечатлението, че писмата му са изпратени от почивен дом: "Все още живея добре; Напълно се установих тук, сякаш така трябва да бъде. Тук дори напълнях, наддадох и физически се чувствам доста добре. За да подобря кръвообращението, започнах да ходя на работа, например, да изпомпвам вода от мазетата на затвора. Хубаво е, че прекарвате малко време на въздух и се развивате малко За работа добавят още 1 фунт хляб, времето минава незабелязано, че книгите се четат бавно, само да е някъде в добър санаториум. Верен на своята "първа любов", архимандрит Иларион дори в затвора намира възможност да разшири научните си познания: "Сега в килията ни се събраха трима професори. Ние изнасяме лекции от време на време; взехме курс по стенография. Наистина смятам, че е необходимо да кажа, че тези 2 месеца. Живях не без полза и дори по-интересно, отколкото живях извън затвора” 305. На 1 юли 1919 г. академичната библиотека преминава под юрисдикцията на Народния комисариат по образованието, но самата академия не престава да съществува, а продължава образователната си дейност до март 1923 г., когато е официално закрита с решение на антирелигиозната комисия към ЦК на RCP (b), ръководена от Е. Ярославски 306. Иларион (Троицки), архим. Писмо от свещеник Леонид и Лидия Архангелски от 9 май 1919 г. – Архив на А.В. Никитски. Сафонов Д.В. Академично служение на schmch. Иларион (Троицки) и неговата борба срещу обновленчеството. С. 341.