Приведений на суд до паші Тірнавоса, що біля Лариси у Фессалії, він безстрашно розповів йому історію свого життя, знову сповідав ім'я Христове та обсипав турків лайкою. Тоді його, голого, провезли через місто на віслюку з головою, вкритою овчиною, але це ганебне видовище стало для нього тріумфальною ходою. Після цього святого мученика було засуджено до відсікання кінцівок. З радістю зустрівши вирок, він сам підставив ногу під сокиру ката, підбадьорюючи його, тоді як останній, наляканий рішучістю святого, зволікав з початком страти. Спрямувавши всією душею до Бога, святий Гедеон не промовив ні слова і навіть не випустив жодного стогін, коли йому відсікали руки та ноги.
Наприкінці дня, коли мученик був ще живий, правитель наказав чотирьом християнам взяти його і кинути у вигрібну яму, де він і помер 30 грудня 1818 року.
Наступного дня, викупивши тіло святого, християни поспішили дати йому гідне поховання. Велика кількість людей, що зібралися вшанувати пам'ять святого Гедеона, бачили, як зі скаліченого тіла мученика дві години поспіль стікала свіжа кров, яка створила безліч чудес. У 1837 році, після багатьох чудесних явлень святого, монастир Каракал придбав велику частину його чудотворних мощей.