Приведенный на суд к паше Тирнавоса, что возле Лариссы в Фессалии, он бесстрашно рассказал ему историю своей жизни, вновь исповедал имя Христово и осыпал турок бранью. Тогда его, нагого, провезли через город на осле с головой, покрытой овчиной, но это позорное зрелище стало для него триумфальным шествием. После этого святой мученик был приговорен к отсечению конечностей. С радостью встретив приговор, он сам подставил ногу под топор палача, ободряя его, в то время как последний, напуганный решимостью святого, медлил с началом казни. Устремившись всей душой к Богу, святой Гедеон не проронил ни слова и даже не испустил ни единого стона, когда ему отсекали руки и ноги.
На закате дня, когда мученик был еще жив, правитель приказал четверым христианам взять его и бросить в выгребную яму, где он и скончался 30 декабря 1818 года.
На следующий день, выкупив тело святого, христиане поспешили дать ему достойное погребение. Большое число людей, собравшихся почтить память святого Гедеона, видели, как из искалеченного тела мученика два часа подряд истекала свежая кровь, сотворившая множество чудес. В 1837 году, после многих чудесных явлений святого, монастырь Каракалл приобрел большую часть его чудотворных мощей.