Adus în judecată în fața Pașa din Tirnavos, lângă Larisa în Tesalia, el i-a spus fără teamă povestea vieții sale, a mărturisit din nou numele lui Hristos și i-a copleșit pe turci cu abuzuri. Apoi el, gol, a fost purtat prin oraș pe un măgar cu capul acoperit cu piele de oaie, dar acest spectacol rușinos a devenit pentru el o procesiune triumfală. După aceasta, sfântul mucenic a fost condamnat să i se taie membrele. După ce a salutat verdictul cu bucurie, el însuși și-a pus piciorul sub securea călăului, încurajându-l, în timp ce acesta din urmă, speriat de hotărârea sfântului, a ezitat să înceapă execuția. Îndreptându-se spre Dumnezeu din tot sufletul, Sfântul Ghedeon nu a scos niciun cuvânt și nici măcar nu a scos un geamăt când i-au fost tăiate brațele și picioarele.
La apus, când martirul era încă în viață, domnitorul a ordonat ca patru creștini să-l ia și să-l arunce într-o cloacă, unde a murit la 30 decembrie 1818.
A doua zi, după ce au cumpărat trupul sfântului, creștinii s-au grăbit să-i dea o înmormântare vrednică. Un mare număr de oameni care s-au adunat pentru a cinsti amintirea Sfântului Ghedeon au văzut cum din trupul mutilat al martirului curgea timp de două ore la rând sânge proaspăt, care a făcut multe minuni. În 1837, după multe apariții miraculoase ale sfântului, mănăstirea Caracal a dobândit majoritatea moaștelor sale miraculoase.