Изведен пред пашу из Тирнавоса, близу Ларисе у Тесалији, он му је неустрашиво испричао причу о свом животу, поново исповедио име Христово и засуо Турке злостављањем. Тада је, голог, на магарцу носио кроз град са главом покривеном овчјом кожом, али је овај срамни призор за њега постао тријумфална поворка. После овога, свети мученик је осуђен на одсецање удова. Дочекавши пресуду са радошћу, он је сам подметнуо ногу под џелатову секиру, храбривши га, док је овај, уплашен светитељевом одлучношћу, оклевао да започне погубљење. Упутивши се свом душом ка Богу, свети Гедеон не прозбори ни реч и чак не изговори ни један уздах када му одсекоше руке и ноге.
На заласку сунца, док је мученик још био жив, владар је наредио четворици хришћана да га узму и баце у септичку јаму, где се упокојио 30. децембра 1818. године.
Сутрадан, купивши тело светитеља, хришћани су пожурили да га достојно сахране. Велики број људи који се окупио да ода почаст светом Гедеону видео је како је два сата заредом текла свежа крв из осакаћеног мученичког тела, која је учинила многа чудеса. Године 1837, после многих чудесних светитељевих јављања, манастир Каракал је стекао већину његових чудотворних моштију.