Изведен на суд пред пашата од Тирнаво, во близина на Лариса во Тесалија, тој бестрашно му ја раскажал приказната за својот живот, повторно го признал Христовото име и ги опсипал Турците со малтретирање. Потоа гол го носеа низ градот на магаре со главата покриена со овча кожа, но овој срамен спектакл му стана триумфална поворка. По ова светиот маченик беше осуден на отсекување на екстремитетите. Откако ја поздравил пресудата со радост, тој самиот ја ставил ногата под секирата на џелатот, охрабрувајќи го, а овој, исплашен од решителноста на светителот, се двоумел да започне со егзекуцијата. Упатувајќи се кон Бога со сета своја душа, свети Гедеон не изговорил ниту еден збор и не изговорил ниту едно офкање кога му биле отсечени рацете и нозете.
На зајдисонце, кога маченикот сè уште бил жив, владетелот им наредил на четворица христијани да го земат и да го фрлат во слив, каде што умрел на 30 декември 1818 година.
Следниот ден, откако го купија телото на светителот, христијаните побрзаа да го погребат достојно. Голем број луѓе кои се собраа да го почитуваат споменот на свети Гедеон, виделе како два часа по ред течела свежа крв од осакатеното тело на маченикот, што направило многу чуда. Во 1837 година, по многу чудесни појави на светителот, манастирот Каракал ги стекнал повеќето негови чудотворни мошти.