وقد قُدِّم للمحاكمة أمام باشا تيرنافوس، بالقرب من لاريسا في ثيساليا، فأخبره بلا خوف قصة حياته، واعترف مرة أخرى باسم المسيح وأمطر الأتراك بالشتائم. ثم حُمل عارياً عبر المدينة على حمار ورأسه مغطى بجلد الغنم، لكن هذا المشهد المخزي أصبح له موكب انتصار. وبعد ذلك حكم على الشهيد المقدس بقطع أطرافه. بعد أن استقبل الحكم بفرح، وضع قدمه تحت فأس الجلاد، وشجعه، في حين أن الأخير، خائفًا من تصميم القديس، تردد في بدء الإعدام. توجه القديس جدعون بكل روحه إلى الله، ولم ينطق بكلمة واحدة ولم ينطق حتى بأنين واحد عندما قطعت ذراعيه وساقيه.
عند غروب الشمس، عندما كان الشهيد لا يزال على قيد الحياة، أمر الحاكم أربعة مسيحيين بأخذه وإلقائه في بالوعة، حيث توفي في 30 ديسمبر 1818.
في اليوم التالي، بعد أن اشترى المسيحيون جسد القديس، سارع المسيحيون إلى دفنه بشكل لائق. ورأى عدد كبير من الأشخاص الذين تجمعوا لتكريم ذكرى القديس جدعون كيف تدفقت الدماء الطازجة من جسد الشهيد المشوه لمدة ساعتين على التوالي، مما أدى إلى العديد من المعجزات. في عام 1837، بعد العديد من الظهورات العجائبية للقديس، حصل دير كاراكال على معظم آثاره العجائبية.