Године 1950. Арсеније је постао искушеник благодатног исповедника - оца Кирила, каснијег игумана манастира Кутлумуш († 1968). Нешто касније, отац Кирил је послао искушеника у манастир Есфигмен, где је Арсеније 1954. године примио ријасофора са именом Аверкиј. Монах искушеник је резигнирано и радосно вршио свако послушање, а довршивши своје, помагао је другој братији да доврше своје дело. Аверкиј се непрестано молио, трудећи се да људи око њега не примећују. Исте године, по савету свог духовног оца, прелази у манастир Филотеј и постаје ученик оца Симеона, познатог по својој врлини. Две године касније, отац Симеон је постригао оца Аверкија у схиму са именом Пајсије – у част митрополита ћесаријског Пајсија ИИ, који је такође био родом из Фарасе Кападокијске. На новом месту отац Пајсије је водио свој ранији живот: трудио се из радозналости и помагао братији колико је могао.
Отац Пајсије се подвизавао у манастиру Стомион у Коници, где је хранио дивље медведе из својих руку, провео три године у самоћи у пустињи Свете горе Синајске (у пећини Свете Епистимије), само недељом спуштајући се у манастир Свете Катарине, а највећи део живота проводио је у Светом Атоливу Хо. Провео је живот у тами, потпуно се предајући Богу, који га је открио и дао људима. Многи, многи су долазили код Старца и налазили упуту и утеху, исцељење и покој својим измученим душама. Из освећене душе Старца преливала се Божанска љубав, из његовог преподобног изгледа избијао је сјај Божанске благодати. Данима за редом старац Пајсије Свјатогорец је неуморно отклањао њихов бол од људи, расипајући око себе божанску утеху.
29. јуна/12. јула 1994. године, после истински мученичке кончине, која му је, по речима самог Старца, донела већу корист од подвижништва целог живота његовог, упокојио се у Господу. Место његове блажене кончине био је манастир Светог Јована Богослова (који је основао сам Старац), који се налази у близини села Суроти, недалеко од Солуна, у Грчкој. Старац Пајсије је сахрањен лево од олтара манастирске цркве Светог Арсенија Кападокијског, који га је крстио у детињству.