През 1950 г. Арсений става послушник на благодатния изповедник - отец Кирил, по-късно игумен на манастира Кутлумуш († 1968 г.). Известно време по-късно отец Кирил изпратил послушника в Есфигменския манастир, където през 1954 г. Арсений приел рясофор с името Аверкий. Монахът-послушник смирено и с радост изпълняваше всяко послушание и след като завърши своето, помагаше на други братя да довършат работата си. Аверкий непрекъснато се молеше, опитвайки се околните да не го забележат. През същата година по съвет на своя духовен отец се премества във Филотейския манастир и става ученик на известния с добродетелта си отец Симеон. Две години по-късно отец Симеон пострига отец Аверкий в малка схима с името Паисий – в чест на Кесарийския митрополит Паисий II, който също е родом от Фараса Кападокийска. На новото място отец Паисий водеше предишния си живот: трудеше се от любопитство и помагаше на братята с каквото може.
Отец Паисий се подвизавал в манастира Стомион в Коница, където хранел от ръцете си диви мечки, прекарал три години в уединение в пустинята на Света Синайска гора (в пещерата на Св. Епистимия), слизайки само в неделя в манастира Св. Екатерина и прекарал по-голямата част от живота си в каливата на Света Гора Атон. Той прекарва живота си в неизвестност, отдавайки се изцяло на Бога, който го разкрива и дава на хората. Много, много идваха при стареца и намираха напътствие и утеха, изцеление и мир за измъчените си души. Божествената любов бликаше от осветената душа на стареца, сиянието на Божествената благодат се излъчваше от преподобния му вид. Дни наред старецът Паисий Святогорец неуморно отнемаше болката от хората, обсипвайки около себе си божествена утеха.
На 29 юни/12 юли 1994 г., след истинско мъченичество, което според самия старец му донесе по-голяма полза от подвизата през целия му живот, той се упокои в Господа. Мястото на блажената му кончина бил женският манастир "Св. Йоан Богослов" (основан от самия старец), разположен близо до село Суроти, недалеч от Солун, в Гърция. Старецът Паисий е погребан вляво от олтара на манастирската църква "Св. Арсений Кападокийски", който го е кръстил в детството.