Потонула помисао на мучеништво почела је да га прогања на сваком кораку, али, међутим, не окушавши се у својој снази, није се усудио да следи своју намеру без припреме и савета искусних стараца.
Желећи да се тачно испита, он се, по благослову игумана Лавре, преселио у манастир Есфигмен, где се ставио под руководство тог истог игумана, који је заједно са старцем Германом учествовао у припреми Светог Агафангела на страдалнички подвиг. Овде се Тимотеј убрзо постриже у велики анђелски лик – схиму и под вођством игумана поче да се припрема да поднесе муке за име Исуса Христа.
Имајући свакодневно пред очима свете мошти Агафангела, Тимотеј је поштовао светог мученика и замолио га у својој молитви да измоли од њега благодат од Сведарног Господа: да пострада за свето име Његово. Као што видите, свети Агатангел је услишио Тимотејеву молбу, јер је његово срце било толико распаљено љубављу према Господу нашем Исусу Христу да није могао више да издржи и желео је да што пре пострада за најслађег Исуса. И зато он објави своју намеру игуману, молећи га да му да благослов за његово мучеништво. Али игуман, желећи да искуша Тимотеја и као да се не обазире на његову молбу, одби му благослов, што, међутим, нимало није сметало Тимотеју, који је из свог дубоког смирења и беспоговорног послушања прихватио речи игумана, као од Самог Господа. У међувремену, протекло је доста времена за које Тимотеј не само да није ослабио у својој намери, већ је чак често подсећао и тражио да буде пуштен на страдалнички подвиг.
Када је искусни вођа видео Тимотејеву непроменљиву и чврсту мисао, пристао је и, давши му свој благослов, послао га је са писмом у мириофитску епархију на обали Пропонтиде јеромонаху Герману, некадашњем пратиоцу светог Агафангела, који је у то време био на црквеном послу у овим местима, молећи га да припреми Тимотеја за страдање.
Стигавши у Пропонтиду, затекао је старца Германа, коме је предао писмо игумана Есфигмена. Прочитавши писмо, Герман са радошћу и братском љубављу прихвати Тимотеја као будућег мученика, утеши га гостопримством и даде му уточиште.
Припремајући Тимотеја за мученички подвиг, Герман се духовно обрадовао што је Господ Бог по великој милости Својој удостојио да припреми још једног мученика за исповедање светог имена Свога, и неколико дана касније, видећи Тимотејеву чврстину у намери, благослови га на мученички подвиг. У исто време, ту је био и Тимотејев следбеник, јеромонах Јевтимије, који се, видевши његову храбру одлучност, распламсао љубомором и пожелео да са њим пострада за Христа и прихвати мучеништво.
И тако, вођени благословом и молитвом, Јевтимије и Тимотеј одоше у Кисани, где уђоше у кућу некадашњег хришћанина, Тимотејевог познаника, а сада изопћеног. После уобичајеног поздрава, Тимотеј је почео да убеђује изгнаника да се поново обрати Христу, претећи му вечним мукама и лишавањем погодности које су припремљене за следбенике Христове. Али огорчени изопћеник, уместо захвалности за њихов добар савет, пријави их судији, који одмах нареди да на судиште доведу свете мученике.
Када су свети мученици ступили на судницу и изашли пред судију, тада су се храбро исповедали као хришћани, изобличујући своју заблуду и лажно веровање у Мухамеда. Судија, чувши хулу на његову веру, узнемири се од гнева и нареди слугама да чврсто вежу руке светитељу. мученика и, сматрајући да њихова кривица не подлеже његовој власти, посла их у Адрианопољ. У исто време, слуге су показивале зверску ревност: руке су светог Тимофеја биле стегнуте тако чврсто да су му рамена била спојена.
Сутрадан су страдалници Христови стигли у Адријанопољ; овде су сазнали да су претходног дана два Христа подвижника, јеромонах Никола и монах Варнава, храбро исповедали хришћанску веру и да су судије после кратког опомене наредиле да их баце у различите тамнице и да их, забивши им ноге у коцке, туку за петама сваког дана током једног месеца, додајући сваки дан по два ударца, сваки дан по два ударца. Ова вест је оснажила Јевтимија и Тимотеја, и они су се радосно радовали страдању за Христа који их је волео.
Када су свети мученици Јевтимије и Тимотеј изведени у суд, тада су судије, после уобичајених опомена, видевши њихову непопустљивост, наредиле да се јеромонах Јевтимије затвори и туче по петама на исти начин као Никола и Варнава, док је Тимотеј остао без казне да га у року од једног месеца не преобрати, да се у року од једног месеца преобрати у веру. месеца би погубљен.
Два дана касније у Адрианопољ је стигао Тимотејев старац Герман, који је преко гласника тајно посетио светог. Мученици су сазнали да желе да се причесте. Христове тајне, и зато одмах отишао у кућну патријаршијску цркву, узео тамо неколико честица антидора и истог дана послао три честице светим мученицима са тим хришћанином који га је обавестио о њиховој жељи да се причести Телом и Крвљу Христовом, и кратким писмом обавестио страдалнике да ће сутра он сам доћи к њима у тамницу. Сутрадан Герман, распитавши се од једног хришћанина да се дужници затварају у исту тамницу у којој су били затворени Јевтимије и Тимотеј, као и због неплаћања пореза, стаде га молити да га пријави порезнику, као да није платио законски порез. Чим је колекционар чуо за ово, одмах је дошао у хотел у коме је Херман боравио и, позвавши га, почео да тражи признаницу за плаћање пореза. А пошто Херман није имао не само признаницу, већ и новац, колекционар га је послао у затвор.
Ко може адекватно да опише радост када су ученици видели свог учитеља у затвору?! Какве ли су им радосне сузе залиле образе при погледу на свог добротвора и ментора! Сви су се забављали и са сузама љубили. Цела ноћ је прошла у бдењу и молитви, а суморна тамница се претворила у цркву; На крају бденија, мученици Христови су се исповедили старцу и потом се причестили Светим Христовим Тајнама. И чим дође јутро, Германа откупише побожни хришћани и пустише га.
У међувремену, на срамоту непријатеља хришћанства, Господ је преко исповедника Својих очито чинио чудеса, јер колико год мучитељи свирепо тукли страстоце по петама, мученици Христови су се, уместо уобичајених стењања, радовали и захваљивали за ударце које су нанели; Након сваког премлаћивања, џелатове руке су се опуштале, а они су, видећи своју слабост, шкргутали зубима од гнева.
Коначно се приближио дан у који је Божији Промисао благоизволео да позове светог мученика Тимотеја. На данашњи дан судије су од њега захтевале да се појави пред судом и после разних ласкавих обећања и претњи наредиле да му се одсече глава и заједно са телом баци у реку, што су извршили џелати 29. октобра 1820. године.
Старац Герман је много туговао јер су душмани Цркве Христове лишили хришћане утехе да имају свете мошти страдалника Христовог Тимотеја, па је зато, желећи да купи макар његову крваву одећу, понудио џелатима знатну суму новца, за шта је добио шта је хтео. Затим је са овим драгоценим бременом отишао на Свету Гору. Пролазећи поред села где су се налазиле кћери светог Тимотеја, Герман им је дошао, саопштио им радосну вест о мученичкој смрти њиховог оца и дао им део светитељеве одежде. По доласку на Свету Гору, братија манастира Есфигмена дочекала је мученичке одежде са крсним ходом, часно их унела у цркву и положила у кивот са одеждама Светог мученика Агафангела.
После погубљења светог Тимотеја, исповедници Христови: Јевтимије, Никола и Варнава, пуштени су из затвора и нечасно протерани из града. Молитвама светог преподобномученика Тимотеја, Христе Боже наш, удостој нас да примимо вечну славу на небесима. Амин.