Potopená myšlienka na mučeníctvo ho začala prenasledovať na každom kroku, ale keďže nevyskúšal svoju silu, neodvážil sa uskutočniť svoj zámer bez prípravy a rady skúsených starších.
Keďže sa chcel presne otestovať, s požehnaním opáta Lavry sa presťahoval do kláštora Esphigmen, kde sa zveril pod vedenie toho istého opáta, ktorý sa spolu so starším Hermanom podieľal na príprave svätého Agafangela na trpiteľský výkon. Tu bol Timotej čoskoro tonzúrovaný do veľkého anjelského obrazu - schémy a pod vedením opáta sa začal pripravovať na muky pre meno Ježiša Krista.
Timotej, ktorý mal denne pred očami relikvie svätého Agafangela, uctieval svätého mučeníka a vo svojej modlitbe ho prosil, aby ho požiadal o milosť od veľmi obdarovaného Pána: trpieť pre jeho sväté meno. Ako môžete vidieť, svätý Agatangel vypočul Timotejovu prosbu, lebo jeho srdce bolo tak zapálené láskou k nášmu Pánovi Ježišovi Kristovi, že to už nemohol ďalej znášať a chcel čo najskôr trpieť pre najsladšieho Ježiša. A preto svoj úmysel oznámil opátovi, prosil ho, aby mu dal požehnanie na jeho mučeníctvo. Ale opát, ktorý chcel Timoteja vyskúšať a ako keby neposlúchol jeho prosbu, odmietol mu jeho požehnanie, čo však Timotejovi vôbec neprekážalo, ktorý zo svojej hlbokej pokory a nespochybniteľnej poslušnosti prijal slová opáta, akoby od samotného Pána. Medzitým uplynulo dosť veľa času, počas ktorého Timotej vo svojom úmysle nielenže neochaboval, ale dokonca často pripomínal a žiadal, aby bol prepustený k trpeniu.
Keď skúsený vodca videl Timotejovu nemennú a pevnú myšlienku, súhlasil a požehnal ho a poslal ho s listom do diecézy Miriophyte na brehu Propontisu Hieromonkovi Hermanovi, bývalému spoločníkovi svätého Agafangela, ktorý v tom čase mal na týchto miestach cirkevné záležitosti, v ktorom ho požiadal, aby pripravil Timoteja na trpiteľský výkon.
Keď prišiel do Propontisu, našiel staršieho Hermana, ktorému odovzdal list od opáta z Esphigmen. Po prečítaní listu Herman s radosťou a bratskou láskou prijal Timoteja ako budúceho mučeníka, utešil ho pohostinnosťou a poskytol mu prístrešie.
Herman pripravoval Timoteja na mučeníctvo a duchovne sa radoval, že Pán Boh sa rozhodol vo svojom veľkom milosrdenstve pripraviť ešte jedného mučeníka na vyznanie svojho svätého mena, a o niekoľko dní, keď videl Timotejov pevný úmysel, požehnal ho za mučeníctvo. V tom istom čase tu bol aj Timotejov nasledovník, Hieromonk Euthymius, ktorý, keď videl jeho odvážne odhodlanie, vzplanul žiarlivosťou a chcel s ním trpieť pre Krista a prijať mučeníctvo.
A tak, vedení požehnaním a modlitbou, Euthymius a Timotej odišli do Kisani, kde vošli do domu bývalého kresťana, Timotejovho známeho, ale teraz vyhnaného. Po zvyčajnom pozdrave začal Timoteus presviedčať vyhnanca, aby sa opäť obrátil ku Kristovi, pričom sa mu vyhrážal večným trápením a zbavením výhod, ktoré sú pripravené pre Kristových nasledovníkov. Ale zatrpknutý vyvrheľ ich namiesto vďačnosti za ich dobré rady udal sudcovi, ktorý hneď nariadil priviesť na súdnu stolicu mučeníkov sv.
Keď svätí mučeníci vstúpili do súdnej stolice a predstúpili pred sudcu, potom sa odvážne priznali, že sú kresťania, odsudzujúc svoj blud a falošnú vieru v Mohameda. Keď sudca počul rúhanie proti jeho viere, prekypel hnevom a prikázal sluhom, aby svätcovi pevne zviazali ruky. mučeníkov späť a vzhľadom na to, že ich vinu nepodliehali jeho autorite, poslal ich do Adrianopolu. V rovnakej dobe, služobníci ukázali brutálnu horlivosť: sú to ruky svätého Timofey bol stiahnutý tak pevne, že jeho ramená boli spojené dohromady.
Na druhý deň prišli Kristovi trpiaci do Adrianopolu; tu sa dozvedeli, že deň predtým dvaja Kristovi askéti, hieromónec Mikuláš a mních Barnabáš, odvážne vyznávali kresťanskú vieru a že po krátkom napomenutí ich sudcovia nariadili, aby ich uvrhli do rôznych väzníc a keď im vrazili nohy do pažby, aby ich každý deň po dobu jedného mesiaca bili po pätách, pričom každý deň pridali dve rany, počnúc tridsiatimi ôsmimi ranami. Táto správa posilnila Euthymia a Timoteja a s radosťou očakávali utrpenie pre Krista, ktorý ich miloval.
Keď boli mučeníci Euthymius a Timotej predvedení na súd, sudcovia po zvyčajných napomenutiach, vidiac ich nepružnosť, nariadili Hieromonka Euthymia uväzniť a biť do päty rovnakým spôsobom ako Mikuláša a Barnabáša, zatiaľ čo Timotej zostal bez trestu a vyhlásili mu, že ak sa do jedného mesiaca neobráti na moslima, bude odsúdený na smrť.
O dva dni prišiel do Adrianopolu Timotejov starší Herman, ktorý prostredníctvom posla tajne navštívil sv. Mučeníci sa dozvedeli, že chcú prijať sväté prijímanie. Kristove tajomstvá, a preto okamžite išli do domácej patriarchálnej cirkvi, vzali tam niekoľko čiastočiek antidory a v ten istý deň poslali tri čiastočky svätým mučeníkom s tým kresťanom, ktorý ho informoval o svojej túžbe prijať Telo a Krv Kristovu a v krátkom liste informoval trpiacich, že zajtra k nim sám príde do väzenia. Na druhý deň sa Herman spýtal jedného kresťana, že v tom istom väzení, v ktorom boli uväznení aj Euthymius a Timotej, väznení dlžníci, ako aj pre neplatenie daní, začal ho žiadať, aby ho nahlásil colníkovi, ako keby nezaplatil zákonnú daň. Len čo sa o tom zberateľ dozvedel, okamžite prišiel do hotela, kde bol Herman ubytovaný, a zavolal mu a začal požadovať potvrdenie o zaplatení daní. A keďže Herman nemal nielen účtenku, ale ani peniaze, vyberač ho poslal do väzenia.
Kto dokáže primerane opísať tú radosť, keď žiaci videli svojho učiteľa vo väzení?! Aké radostné slzy im zaliali líca pri pohľade na ich dobrodinca a mentora! Všetci sa zabávali a bozkávali sa so slzami. Celú noc sa nieslo v bdení a modlitbách a ponuré väzenie sa zmenilo na kostol; Na konci vigílie Kristovi mučeníci vyspovedali svojho staršieho a potom prijali sväté Kristove tajomstvá. A len čo prišlo ráno, Hermana vykúpili zbožní kresťania a prepustili ho.
Medzitým, na hanbu nepriateľov kresťanstva, Pán jasne robil zázraky prostredníctvom svojich spovedníkov, lebo akokoľvek kruto mučitelia bili pašijníkov po pätách, Kristovi mučeníci sa namiesto zvyčajných stonov radovali a ďakovali za údery, ktoré zasadili; Po každom bití sa ruky katov uvoľnili a keď videli svoju slabosť, od zlosti škrípali zubami.
Napokon sa priblížil deň, keď Božia Prozreteľnosť rada povolala svätého mučeníka Timoteja. V tento deň ho sudcovia vyzvali, aby sa dostavil pred súd a po rôznych lichotivých sľuboch a vyhrážkach mu nariadili odrezať hlavu a spolu s telom hodiť do rieky, čo 29. októbra 1820 vykonali kati.
Starší Herman bol veľmi zarmútený, pretože nepriatelia Kristovej cirkvi pripravili kresťanov o útechu, že mali sv. relikvie trpiaceho Krista Timoteja, a preto, že si chcel kúpiť aspoň jeho krvavé šaty, ponúkol katom značné množstvo peňazí, za ktoré dostal, čo chcel. Potom s týmto vzácnym bremenom odišiel na Svätú Horu. Herman, ktorý prešiel popri dedine, kde k nim prišli dcéry svätého Timoteja, im povedal radostnú správu o mučeníctve ich otca a dal im časť svätcovho rúcha. Po príchode na horu Athos sa bratia z kláštora Esphigmen stretli s mučeníckymi odevmi s krížovou procesiou, so cťou ich vniesli do kostola a uložili do archy s odevom svätého mučeníka Agafangela.
Po poprave svätého Timoteja boli vyznávači Krista: Euthymius, Mikuláš a Barnabáš prepustení z väzenia a nečestne vyhnaní z mesta. Skrze modlitby svätého ctihodného mučeníka Timoteja, Kriste, Bože náš, učiň nás hodnými prijať večnú slávu v nebi. Amen.